Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Calb1P12658 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Calb1P12658 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms