Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Timp1P12032 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms