Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P10404 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P10404 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P10404 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P10404 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P10404 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P10404 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P10404 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P10404 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P10404 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P10404 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms