Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms