Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Egr1P08046 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Egr1P08046 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms