Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06321 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06321 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06321 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06321 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06321 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06321 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06321 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06321 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06321 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06321 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06321 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms