Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc1P02468 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms