Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tp53P02340 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tp53P02340 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms