Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01807 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01807 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
P01807 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01807 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01807 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01807 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01807 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01807 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms