Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01673 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01673 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
P01673 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01673 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01673 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms