Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01672 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01672 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01672 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01672 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01672 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01672 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01672 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01672 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01672 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01672 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01672 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms