Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms