Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AurkcO88445 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms