Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp4O70480 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms