Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb5O70309 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms