Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx4O55187 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx4O55187 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms