Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FxnO35943 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FxnO35943 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FxnO35943 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FxnO35943 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FxnO35943 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FxnO35943 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FxnO35943 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FxnO35943 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FxnO35943 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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