Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gp1baO35930 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms