Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pik3cdO35904 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms