Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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