Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf18O35714 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms