Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx8O35652 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lhx8O35652 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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