Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-ObO35424 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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H2-ObO35424 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-ObO35424 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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H2-ObO35424 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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