Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms