Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms