Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Scarb2O35114 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarb2O35114 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Scarb2O35114 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Scarb2O35114 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Scarb2O35114 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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