Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NumblO08919 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NumblO08919 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NumblO08919 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NumblO08919 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NumblO08919 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NumblO08919 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NumblO08919 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms