Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r78K7N6U5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms