Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5849J3QPE5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms