Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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