Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21897J3KMP5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms