Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfip1G5E8V9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms