Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rdh19G5E8H9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rdh19G5E8H9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rdh19G5E8H9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Rdh19G5E8H9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rdh19G5E8H9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rdh19G5E8H9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rdh19G5E8H9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh19G5E8H9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms