Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r58G3X9U3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms