Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms