Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms