Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms