Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms