Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Taf4E9QAP7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Taf4E9QAP7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Taf4E9QAP7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Taf4E9QAP7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Taf4E9QAP7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf4E9QAP7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms