Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc141E9Q8Q6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc141E9Q8Q6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc141E9Q8Q6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc141E9Q8Q6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc141E9Q8Q6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc141E9Q8Q6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms