Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pgbd1E9Q492 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms