Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp1E9Q368 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms