Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pdzd2E9Q1M1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzd2E9Q1M1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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