Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd2E9PZM4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd2E9PZM4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms