Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms