Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms