Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc175E9PVB3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms