Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifit3bE9PV48 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms