Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms