Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Soga1E1U8D0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms